21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1796 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  45.3 
 
 
350 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  37.82 
 
 
419 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  37.44 
 
 
364 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  36.27 
 
 
394 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  35.89 
 
 
286 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  32.98 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  30.94 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  33 
 
 
379 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  29.91 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  29.82 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  28.48 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.74 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  30.69 
 
 
732 aa  65.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  27.56 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  26.28 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  31.61 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  23.74 
 
 
443 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 
377 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.616918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>