27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2245 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  75.68 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  42.8 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  40.98 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  38.3 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  41.4 
 
 
315 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  39.15 
 
 
379 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  34.93 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  35.96 
 
 
732 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  35.07 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.9 
 
 
251 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  32.26 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  33.65 
 
 
286 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  32.79 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  31.6 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  32.12 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  28.44 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  30.67 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.616918 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  25.98 
 
 
443 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.41 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.35 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1678  hypothetical protein  29.38 
 
 
319 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61648  predicted protein  20.62 
 
 
438 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.444287  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5537  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.1 
 
 
348 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2273  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.98 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0064952  normal  0.143874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>