28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2547 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
251 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  38.5 
 
 
364 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  33.19 
 
 
399 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  34.9 
 
 
419 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  33.64 
 
 
394 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  31.79 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  27.87 
 
 
443 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  29.2 
 
 
324 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  29.73 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  30.41 
 
 
329 aa  79  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  31.6 
 
 
334 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  35.14 
 
 
280 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  30.52 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  32.43 
 
 
379 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  33 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  30.74 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  29.68 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  29.6 
 
 
732 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  30.13 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2406  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.8 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111286  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1527  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.47 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0436  hypothetical protein  23.55 
 
 
353 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4417  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.56 
 
 
388 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.969405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1678  hypothetical protein  23.4 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.12 
 
 
359 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.81 
 
 
340 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>