28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  38.64 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  43.58 
 
 		 288 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  38.82 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  45.37 
 
 		 732 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  39.04 
 
 		 399 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  37.26 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  37.75 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  34.84 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  36.2 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  32.7 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  36.32 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  32.86 
 
 		 260 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5176  hypothetical protein  61.73 
 
 		 95 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  35.55 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  32.57 
 
 		 281 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  33.88 
 
 		 216 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  32.42 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2377  hypothetical protein  46.32 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411758  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  27.46 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.57 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2515  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.596079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.87 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.54 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2273  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.9 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0064952  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1527  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  22.35 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>