21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2727 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  43.31 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  39.66 
 
 		 419 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  39.13 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  39.83 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  39.38 
 
 		 394 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  39.71 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  35.89 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  32.38 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  32.74 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  32.91 
 
 		 329 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  31.91 
 
 		 399 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  86.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  36.31 
 
 		 732 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  32 
 
 		 334 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  31.84 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.14 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  26.24 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  24.64 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  31.85 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>