22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0115 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  68.22 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  46.52 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  39.19 
 
 		 280 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  36.97 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  44.76 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  36.27 
 
 		 281 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  34.84 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  33.77 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  32.03 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  31.2 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.49 
 
 		 251 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  28.44 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  29.57 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  37.64 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  26.71 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  28.64 
 
 		 732 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.51 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.57 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>