90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1206 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  86.79 
 
 
439 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  100 
 
 
439 aa  892    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  33.33 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  30.57 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  30.57 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  30.57 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  30.57 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  30.57 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  30.57 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  29.9 
 
 
369 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  30.57 
 
 
373 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.11 
 
 
373 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  31.13 
 
 
373 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  31.13 
 
 
373 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.3 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  32.65 
 
 
357 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  30.58 
 
 
373 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.58 
 
 
373 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  29.5 
 
 
373 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.98 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  30.8 
 
 
365 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  34.33 
 
 
383 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  33.08 
 
 
364 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  29.55 
 
 
361 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  29.55 
 
 
361 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  41.04 
 
 
382 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.76 
 
 
365 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  29.09 
 
 
337 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  33.54 
 
 
364 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  37.14 
 
 
362 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  29.45 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  35.92 
 
 
366 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  26.72 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  35.29 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  32.77 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  27.14 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  21.8 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.59 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  35.96 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  35.09 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  31.72 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.25 
 
 
345 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  31.78 
 
 
346 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.58 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  36.28 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  31.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  30.71 
 
 
520 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  31.73 
 
 
789 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  30.1 
 
 
790 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  35.9 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  33.64 
 
 
344 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  31.25 
 
 
342 aa  60.1  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  30.4 
 
 
354 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  31.07 
 
 
518 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  29.1 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  32.74 
 
 
533 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.17 
 
 
343 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  28.97 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  36.19 
 
 
518 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  28.37 
 
 
356 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  28.37 
 
 
356 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  31.19 
 
 
357 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  28.37 
 
 
356 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  31.19 
 
 
357 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  29.05 
 
 
371 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  23.81 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  25.47 
 
 
354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  27.83 
 
 
352 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  34.31 
 
 
518 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  26.98 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  34.31 
 
 
520 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  26.17 
 
 
598 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  26.76 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  24.44 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  23.08 
 
 
467 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  30.51 
 
 
638 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  30.51 
 
 
627 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  30.51 
 
 
653 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  30.51 
 
 
642 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  30.51 
 
 
623 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  30.51 
 
 
630 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  30.51 
 
 
635 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  28.26 
 
 
508 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  22.86 
 
 
469 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>