45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2793 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  85.21 
 
 
478 aa  848    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  100 
 
 
477 aa  984    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  85.21 
 
 
478 aa  847    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  31.02 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  31.15 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  31.13 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  31.49 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  31.49 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  30.7 
 
 
454 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  30.54 
 
 
455 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  30.32 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  30.18 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  50.94 
 
 
453 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  28.96 
 
 
463 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  30.2 
 
 
465 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  31.64 
 
 
471 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  47.62 
 
 
411 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  24.42 
 
 
458 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  34.73 
 
 
383 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  24.84 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  28.34 
 
 
421 aa  67  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  27.43 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  31.3 
 
 
653 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  31.3 
 
 
635 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  31.3 
 
 
638 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  31.3 
 
 
627 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  31.3 
 
 
623 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  31.3 
 
 
630 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  31.3 
 
 
642 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  31.3 
 
 
598 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  24.78 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  28.12 
 
 
225 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  31.25 
 
 
365 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  35.96 
 
 
337 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  26.92 
 
 
533 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  31.78 
 
 
789 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  22.52 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  26.19 
 
 
522 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  24.11 
 
 
520 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  29.91 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  28.7 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  29.91 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.37 
 
 
508 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  24.28 
 
 
518 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  33.33 
 
 
528 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>