38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1804 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  74.29 
 
 
471 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
463 aa  939    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  41.18 
 
 
455 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  40.96 
 
 
455 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  40.96 
 
 
455 aa  299  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  40.59 
 
 
465 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  36.5 
 
 
458 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
437 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  28.94 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  28.94 
 
 
450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  28.94 
 
 
469 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  30.97 
 
 
453 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  29.64 
 
 
454 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  28.75 
 
 
477 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  27.68 
 
 
478 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  27.49 
 
 
478 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 
383 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  35.8 
 
 
411 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  22.09 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  28.28 
 
 
365 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  28.43 
 
 
508 aa  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  30.77 
 
 
337 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  30.77 
 
 
533 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  25.77 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  31.68 
 
 
791 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  27.52 
 
 
520 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  25.76 
 
 
527 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  33.64 
 
 
533 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  33.64 
 
 
533 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  30.17 
 
 
528 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.26 
 
 
373 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  28.26 
 
 
373 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.17 
 
 
373 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  28.26 
 
 
373 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  28.26 
 
 
373 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.26 
 
 
373 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  31.36 
 
 
372 aa  43.5  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>