46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1094 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  100 
 
 
411 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  96.5 
 
 
453 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  94.9 
 
 
454 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  73.79 
 
 
450 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  73.79 
 
 
450 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  73.79 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  41.4 
 
 
435 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  41.4 
 
 
437 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  28.82 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  28.82 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  29.55 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  29.3 
 
 
455 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  29.01 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  28.73 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  33.05 
 
 
471 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  29.56 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  29.91 
 
 
465 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  33.2 
 
 
463 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  39.18 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  39.18 
 
 
280 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  38.14 
 
 
286 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  37.63 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  33.04 
 
 
293 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  34 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  33.67 
 
 
211 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  41.18 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  37.21 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  37.21 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  31.97 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  31.97 
 
 
533 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  43.28 
 
 
791 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  31.97 
 
 
533 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  31.69 
 
 
527 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  32.5 
 
 
337 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  38.81 
 
 
534 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  32.29 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  28.68 
 
 
523 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  28.03 
 
 
524 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  29.17 
 
 
484 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  31.11 
 
 
225 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  22.15 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  32.31 
 
 
533 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  35.82 
 
 
530 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  22.58 
 
 
437 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  31.58 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>