18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0252 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  590  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  47.08 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  43.6 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  45.83 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  46.51 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  34.75 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  34.75 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  37.13 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  26.25 
 
 		 484 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  26.25 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  26.25 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  41.18 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  22.53 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  22.98 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  23.56 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  23.97 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4243  hypothetical protein  30.86 
 
 		 93 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>