18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3653 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  84.62 
 
 
286 aa  510  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  70.38 
 
 
287 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  70.36 
 
 
280 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  43.6 
 
 
290 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  37.8 
 
 
306 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  44.51 
 
 
211 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  37.8 
 
 
293 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  49.47 
 
 
206 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  28.14 
 
 
484 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  27.76 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  26.17 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  37.63 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  23.89 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  24.56 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  23.17 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  22.29 
 
 
315 aa  45.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>