19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0405 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  424  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  99.53 
 
 
306 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  98.1 
 
 
293 aa  417  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  40.47 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  44.51 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  40.59 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  43.23 
 
 
286 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  37.13 
 
 
290 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  61.05 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  32.02 
 
 
484 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4243  hypothetical protein  57.95 
 
 
93 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  31.82 
 
 
304 aa  92  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  31.82 
 
 
304 aa  92  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  30.41 
 
 
338 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  32.45 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  31.13 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  33.55 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  33.67 
 
 
411 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  30.28 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>