20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1310 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  98.98 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  99.53 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  54.68 
 
 		 206 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3089  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.711159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  35.76 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  37.25 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  34.75 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  37.8 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  29.87 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  32.02 
 
 		 484 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4243  hypothetical protein  57.95 
 
 		 93 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  32.45 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  31.13 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  28.8 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  34 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  30.28 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>