16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4242 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  54.68 
 
 		 306 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  55.79 
 
 		 293 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  61.05 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  49.47 
 
 		 286 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  46.88 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  46.88 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  49.47 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3089  hypothetical protein  57.65 
 
 		 92 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.711159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  26.24 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  35.56 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  26.24 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  35.29 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  48.65 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  40.54 
 
 		 411 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>