17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3902 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  64.77 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  46.43 
 
 		 306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  45.82 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  31.91 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  23.89 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  31.13 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  31.13 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  34.62 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  24.55 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  25.22 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  28.49 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  26.13 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  35.29 
 
 		 206 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  23.97 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  25.38 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  25.38 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>