17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2516 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  31.91 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  31.88 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  39.58 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  32 
 
 		 484 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  30.41 
 
 		 211 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  32.1 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  25.53 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  26.32 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  29.56 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  30.19 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  27.92 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  22.98 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  21.84 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  22.91 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1185  hypothetical protein  33.91 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>