18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3057 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  99.29 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  73.31 
 
 		 286 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  70.36 
 
 		 285 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  46.51 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  37.25 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  40.59 
 
 		 211 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  37.65 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  32.74 
 
 		 484 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  46.88 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  39.18 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  26.95 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  31.37 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  24.55 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  26.72 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  23.84 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>