77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3656 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  100 
 
 		 527 aa  1052    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  51.71 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  49.14 
 
 		 523 aa  475  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  41.54 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  40.8 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  40.8 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  40.8 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  41.52 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  40.27 
 
 		 530 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  41.02 
 
 		 791 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.75 
 
 		 508 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  27.59 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  26.61 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  26.27 
 
 		 789 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  25.33 
 
 		 790 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  26.25 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  23.05 
 
 		 513 aa  90.5  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  31.15 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  26.62 
 
 		 518 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  29.81 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  26.58 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  20.54 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  22.97 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  26.09 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  25.69 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  26.15 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  25.43 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  28.96 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  28.96 
 
 		 454 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  26.26 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  34.38 
 
 		 598 aa  57  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  32.84 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  32.84 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  35.16 
 
 		 642 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  35.16 
 
 		 630 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  35.16 
 
 		 638 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  35.16 
 
 		 653 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  33.86 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  33.86 
 
 		 627 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  33.07 
 
 		 635 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  35.24 
 
 		 367 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  31.69 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  25.72 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  30.3 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  30.53 
 
 		 450 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  30.53 
 
 		 450 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  34.12 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  23.41 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  31.09 
 
 		 356 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  23.26 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  23.26 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  22.75 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  31.71 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  23.12 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  32.35 
 
 		 352 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  30.56 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  26.78 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  32.41 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  31.62 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  32.41 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  32.41 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  22.93 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  25.76 
 
 		 463 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  30.09 
 
 		 367 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  30.09 
 
 		 367 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  30.09 
 
 		 367 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  30.09 
 
 		 367 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  30.09 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  30.09 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  30.48 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  31.62 
 
 		 455 aa  44.3  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  23.7 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  37.84 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  30.36 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  30.36 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  30.08 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  26.36 
 
 		 533 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>