75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000434 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  65.38 
 
 
434 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  26.12 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  27.85 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  25.93 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  25.58 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  28.78 
 
 
790 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  23.17 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  27.5 
 
 
653 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  27.5 
 
 
642 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  23.17 
 
 
450 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  23.17 
 
 
450 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  27.5 
 
 
638 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  27.5 
 
 
630 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  25.84 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  27.5 
 
 
623 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  27.5 
 
 
627 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  27.5 
 
 
635 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  27.59 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  23.93 
 
 
533 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  30.91 
 
 
530 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  26.67 
 
 
598 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.57 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.52 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  24.52 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  28.89 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  24.78 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  24.78 
 
 
478 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.15 
 
 
373 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  24.78 
 
 
477 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  26.95 
 
 
454 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  26.95 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  28.89 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.89 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  28.89 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  29.37 
 
 
365 aa  60.1  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  25.23 
 
 
533 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  25.23 
 
 
533 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  26.67 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  25.23 
 
 
533 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  29.09 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  27.27 
 
 
534 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  25.93 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  25.93 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  25.93 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  25.93 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  25.93 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  25.58 
 
 
518 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  25.93 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  25.22 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  25.93 
 
 
373 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  29 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  24.77 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  27.18 
 
 
455 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  25.93 
 
 
357 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  27.68 
 
 
791 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  26.24 
 
 
518 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  23.47 
 
 
508 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  26.45 
 
 
366 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  26.27 
 
 
383 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  25.42 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  23.01 
 
 
524 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  26.67 
 
 
342 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  25.62 
 
 
366 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.32 
 
 
439 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  25.18 
 
 
520 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  27.88 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  27.88 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.41 
 
 
339 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  21.64 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  21.93 
 
 
523 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  26.85 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  28.89 
 
 
371 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  25.4 
 
 
362 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  28.12 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>