99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5434 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  77.41 
 
 		 518 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  67.5 
 
 		 520 aa  715    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  73.36 
 
 		 518 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  84.23 
 
 		 520 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1049    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  29.44 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  28.17 
 
 		 789 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  27.56 
 
 		 790 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  24.09 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  29.39 
 
 		 480 aa  133  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  24.57 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  26.3 
 
 		 524 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  23.25 
 
 		 469 aa  120  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  27.44 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  21.78 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  24.95 
 
 		 482 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  26.16 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  26.26 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  22.59 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  25.73 
 
 		 534 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  24.39 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  25.16 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  26.25 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  24.39 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  25.4 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  24.18 
 
 		 533 aa  90.5  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  36.84 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.51 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  24.85 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  27.03 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  25 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  27.82 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  30.84 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.07 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  38.52 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  38.52 
 
 		 638 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  38.52 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  38.52 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  38.52 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  38.52 
 
 		 653 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  38.52 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.63 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  31.45 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  32.81 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.81 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  26.04 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  23.33 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  33.59 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  32.56 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  32.56 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.56 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  32.56 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  24.52 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  22.44 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  31.16 
 
 		 365 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  22.48 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  22.98 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.26 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  22.76 
 
 		 470 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  22.71 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  29.51 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  29.91 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  22.72 
 
 		 488 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  27.92 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  27.92 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.07 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  31.82 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  34.62 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.45 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  27.66 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  28.69 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  26.49 
 
 		 362 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.83 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  28 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.58 
 
 		 343 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  30.28 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  31.03 
 
 		 344 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.13 
 
 		 365 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  22.37 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  27.91 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  30.28 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  29.13 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  30.28 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.39 
 
 		 345 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  23.81 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  23.81 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  28.16 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  27.66 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.85 
 
 		 345 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  21.93 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  21.71 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  29.81 
 
 		 344 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>