66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2497 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  100 
 
 		 364 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  85.48 
 
 		 365 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  83.38 
 
 		 361 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  83.1 
 
 		 361 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  75.21 
 
 		 364 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  55.89 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  34.23 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  34.23 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  34.23 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  34.23 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  33.96 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  33.96 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  33.96 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  34.17 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.88 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  32.88 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  32.53 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.81 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  33.43 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  32.78 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  31.94 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  31.94 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.94 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  29.68 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.32 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  32.87 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  33.06 
 
 		 366 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  31.4 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  27.4 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.89 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.54 
 
 		 439 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.08 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  26.15 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  25.6 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  25 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  24.28 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  25.72 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.72 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  35.64 
 
 		 789 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  27.19 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  36 
 
 		 790 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.18 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  25.6 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  23.96 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.25 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  23.51 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  24.18 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  29.41 
 
 		 520 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  30.83 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  20.65 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.86 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.28 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  23.98 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  23.05 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  26.43 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  32.17 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.88 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  43.14 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  31.43 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  31.43 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  27.73 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  31.19 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  26.5 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  34.62 
 
 		 533 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  30.08 
 
 		 520 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>