58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1208 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
469 aa  967    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  45.11 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  39.13 
 
 
467 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  31.12 
 
 
482 aa  263  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  31.9 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  31.9 
 
 
462 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  29.26 
 
 
480 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  30.04 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  29.67 
 
 
474 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  28.82 
 
 
479 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  30.37 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  30.37 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  28.85 
 
 
470 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  29.72 
 
 
470 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  27.96 
 
 
470 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  25.37 
 
 
488 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  25.59 
 
 
487 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  25.59 
 
 
487 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  24.74 
 
 
487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  23.68 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  26.11 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  22.93 
 
 
789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  24.36 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  24.87 
 
 
533 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  22.57 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  23.95 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  26.32 
 
 
520 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  19.37 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  19.79 
 
 
523 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  22.89 
 
 
790 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  20.59 
 
 
524 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  20.54 
 
 
527 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  22.2 
 
 
533 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  20.91 
 
 
530 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  22.2 
 
 
533 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  22.59 
 
 
533 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1180  putative nucleobase:cation symporter  21.35 
 
 
426 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  22.18 
 
 
528 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  31.75 
 
 
627 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  30.95 
 
 
635 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  30.95 
 
 
623 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  30.95 
 
 
630 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  30.95 
 
 
653 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  30.95 
 
 
638 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  30.95 
 
 
642 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  23.39 
 
 
791 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  23.33 
 
 
534 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  30.71 
 
 
598 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.71 
 
 
439 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  23.87 
 
 
498 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  23.42 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  27.36 
 
 
366 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  23.42 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  23.42 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  26.21 
 
 
352 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  24.27 
 
 
354 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  22.86 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  27.36 
 
 
366 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>