31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3135 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  100 
 
 
458 aa  926    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  40.21 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  42.16 
 
 
465 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  39.36 
 
 
455 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  39.1 
 
 
455 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  37.75 
 
 
463 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  34.8 
 
 
471 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  32.49 
 
 
435 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  32.65 
 
 
437 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  29.18 
 
 
469 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  29.49 
 
 
450 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  29.49 
 
 
450 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  30.46 
 
 
453 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  29.87 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
383 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  24.95 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  24.77 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  24.77 
 
 
477 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  29.56 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  27.66 
 
 
518 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  21.73 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  23.58 
 
 
434 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  28.89 
 
 
528 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  29.37 
 
 
790 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  23.78 
 
 
520 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  19.57 
 
 
401 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  29.14 
 
 
533 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  26.9 
 
 
518 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  28.57 
 
 
533 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  26.7 
 
 
534 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  28.57 
 
 
533 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>