39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0233 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  99.32 
 
 		 450 aa  895    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  100 
 
 		 469 aa  962    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  74.23 
 
 		 454 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  99.55 
 
 		 450 aa  897    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  75.57 
 
 		 453 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  73.79 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  44.47 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  43.91 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  32.54 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  32.45 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  32.23 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  29.93 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  30.61 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  31.66 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  31.07 
 
 		 465 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  28.94 
 
 		 463 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  29.18 
 
 		 458 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  26.72 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  30.87 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  29.08 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  28.37 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  30.38 
 
 		 533 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  30.38 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  30.38 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  25.43 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  33.91 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  36.27 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  33.98 
 
 		 530 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  30.83 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  29.52 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  30.63 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  22.91 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.3 
 
 		 527 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  30.68 
 
 		 337 aa  50.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  32.04 
 
 		 528 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  25.56 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  26.55 
 
 		 790 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  25.66 
 
 		 789 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>