24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2515 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  813    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  27.51 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  29.81 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  29.81 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  32.12 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  24.84 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  22.36 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  22.36 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  25.43 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  25.43 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  25.43 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  22.78 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  22.78 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  26.01 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  25.43 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  25.58 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  19.57 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  21.21 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  22.15 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  31.43 
 
 		 789 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  30.1 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  32.86 
 
 		 790 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  22.86 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>