43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2583 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  100 
 
 		 455 aa  904    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  97.14 
 
 		 455 aa  883    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  97.14 
 
 		 455 aa  880    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  78.12 
 
 		 465 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  41.18 
 
 		 463 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  42.8 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  39.36 
 
 		 458 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  36.97 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  36.75 
 
 		 437 aa  236  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  32.45 
 
 		 450 aa  203  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  32.45 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  32.23 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  30.36 
 
 		 453 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  30.4 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  29.28 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  28.86 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  30.72 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  38.22 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  42.31 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  26.98 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  21.48 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  36.44 
 
 		 638 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  36.44 
 
 		 653 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  36.44 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  36.44 
 
 		 627 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  36.44 
 
 		 642 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  36.44 
 
 		 623 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  36.44 
 
 		 635 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  38.53 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  37.25 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  36.27 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  36.27 
 
 		 533 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  26.01 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  24.77 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  31.75 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  30.28 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 530 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  34.31 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  29.2 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  33.7 
 
 		 337 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  30.84 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  27.35 
 
 		 225 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.69 
 
 		 527 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>