49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1084 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  100 
 
 		 478 aa  992    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  97.91 
 
 		 478 aa  956    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  85.21 
 
 		 477 aa  842    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  33.4 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  32.37 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  29.86 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  29.26 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  29.86 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  31.4 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  29.28 
 
 		 455 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  28.94 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  29.07 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  52.2 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  31 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  27.68 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  48.41 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  26.65 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  25.06 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.93 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  33.04 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  33.04 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  33.04 
 
 		 635 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  33.04 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  33.04 
 
 		 630 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  33.04 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  33.04 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  27.43 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  22.36 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  32.17 
 
 		 598 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  24.78 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  25.95 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  25.78 
 
 		 225 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  28.12 
 
 		 365 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  26.71 
 
 		 790 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  32.38 
 
 		 533 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  37.04 
 
 		 528 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  32.38 
 
 		 533 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  24.62 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  30.34 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  33.75 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  31.78 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.03 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  28.42 
 
 		 508 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  23.62 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  28.26 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  28.26 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.26 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.36 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  21.71 
 
 		 518 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>