74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05856 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  899    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  65.38 
 
 
437 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  27.22 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  24.61 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  27.85 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  25 
 
 
518 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  22.96 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  24.14 
 
 
789 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  21.41 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  27.43 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  27.43 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  27.43 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  27.5 
 
 
627 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  27.5 
 
 
642 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  29.08 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  27.5 
 
 
653 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  27.5 
 
 
623 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  27.5 
 
 
638 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  27.5 
 
 
630 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  29.08 
 
 
450 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  27.5 
 
 
635 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  26.67 
 
 
598 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  29.08 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  21.48 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  25.9 
 
 
790 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  30.91 
 
 
530 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  26.24 
 
 
454 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  26.24 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  31.82 
 
 
528 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  24.77 
 
 
508 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  28.18 
 
 
533 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  28.18 
 
 
533 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  30 
 
 
534 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  27.91 
 
 
365 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  27.03 
 
 
533 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.32 
 
 
373 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  25.32 
 
 
373 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  24.03 
 
 
533 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.05 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  27.41 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.86 
 
 
369 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  24.14 
 
 
522 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  24.68 
 
 
373 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  24.68 
 
 
373 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.68 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  25.58 
 
 
518 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  26.27 
 
 
383 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  28 
 
 
337 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  26.95 
 
 
518 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  24.58 
 
 
471 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  25.93 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  23.91 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  26.79 
 
 
791 aa  49.7  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  25.19 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  25.19 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  25.19 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  26.32 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  25.19 
 
 
373 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  25.19 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  25.19 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  25.19 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  24.79 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  25.62 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.49 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  25.18 
 
 
465 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  25.44 
 
 
523 aa  46.6  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  25.77 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  26.4 
 
 
342 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  23.97 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  30.1 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.05 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  25.18 
 
 
520 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  27.27 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  25.95 
 
 
362 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>