62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5997 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  100 
 
 
382 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  51.48 
 
 
383 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  31.71 
 
 
371 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  30.75 
 
 
362 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  32.38 
 
 
366 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  31.87 
 
 
366 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  29.44 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  28.31 
 
 
373 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.31 
 
 
373 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  27.42 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  27.2 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  26.12 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.53 
 
 
373 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.89 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  28.27 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  29.06 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  27.25 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.01 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  28.2 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  28.2 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.94 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.36 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  41.04 
 
 
439 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  27.72 
 
 
369 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  39.86 
 
 
439 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  26.18 
 
 
373 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  26.48 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  26.82 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  26.82 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  26.48 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  26.48 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  26.48 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  23.71 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  26.22 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  35.57 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  23.71 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  26.33 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.41 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  31.65 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  24.79 
 
 
361 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  33.33 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  25.87 
 
 
461 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.47 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.5 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  30.34 
 
 
341 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  33.04 
 
 
344 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  28.89 
 
 
533 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  29.71 
 
 
520 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  29.84 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  29.84 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  29.49 
 
 
434 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.31 
 
 
342 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  26.75 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  26.75 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  27.54 
 
 
522 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.42 
 
 
363 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>