115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4920 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  100 
 
 
369 aa  752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  70.59 
 
 
373 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  70.59 
 
 
373 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  70.59 
 
 
373 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  70.32 
 
 
373 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  70.32 
 
 
373 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  70.59 
 
 
373 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  70.32 
 
 
373 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  69.11 
 
 
369 aa  524  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  67.11 
 
 
373 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  66.58 
 
 
373 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  67.11 
 
 
373 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  66.58 
 
 
373 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  66.04 
 
 
373 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  66.04 
 
 
373 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  65.78 
 
 
373 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  53.22 
 
 
337 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  42.54 
 
 
365 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  42.51 
 
 
357 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  35.39 
 
 
371 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.38 
 
 
364 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  31.69 
 
 
361 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  29.73 
 
 
366 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  31.15 
 
 
361 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  30.27 
 
 
366 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.23 
 
 
365 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  28.3 
 
 
364 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  31.47 
 
 
362 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  31.44 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.38 
 
 
382 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.58 
 
 
439 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.14 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  26.79 
 
 
383 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  26.2 
 
 
372 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  27.61 
 
 
368 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  28.42 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.79 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  26.65 
 
 
372 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  23.62 
 
 
371 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  35.07 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.63 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.85 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.7 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  35.43 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  36.97 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  40 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  36.43 
 
 
518 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  29.7 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  23.8 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  29.7 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  37.4 
 
 
518 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  24.93 
 
 
376 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  35.81 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  35.81 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.04 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  36.94 
 
 
352 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  28.89 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  34.21 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  35.14 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  33.33 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  35.4 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  23 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  30.34 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  33.33 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  34.88 
 
 
520 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  29.49 
 
 
340 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  27.86 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  23.82 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  29.6 
 
 
789 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  34.45 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  34.45 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  28.46 
 
 
790 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  29.63 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  29.63 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  29.63 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  27.27 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  29.63 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  29.63 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  29.63 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  26.36 
 
 
533 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  29.52 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.83 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  24.55 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  30.5 
 
 
627 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  25.99 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  30.5 
 
 
635 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  30.5 
 
 
623 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  30.5 
 
 
642 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  30.5 
 
 
630 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  30.5 
 
 
638 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  30.5 
 
 
653 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>