103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1799 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  61.61 
 
 
533 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
530 aa  1064    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  61.42 
 
 
533 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  61.24 
 
 
533 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  60.11 
 
 
534 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  52.17 
 
 
528 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  43.08 
 
 
524 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  42.77 
 
 
523 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  40.27 
 
 
527 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  59.39 
 
 
791 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  26.37 
 
 
520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  25.98 
 
 
508 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  27.89 
 
 
498 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  27.7 
 
 
789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  26.26 
 
 
518 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  25.86 
 
 
790 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.69 
 
 
533 aa  97.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  27.1 
 
 
518 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  26.91 
 
 
518 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  23.69 
 
 
522 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  25.74 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  28.24 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  26.69 
 
 
470 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  22.43 
 
 
513 aa  70.1  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  26.61 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  30.91 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  26.07 
 
 
470 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  25 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  30.91 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  31.21 
 
 
435 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  24.69 
 
 
480 aa  64.3  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  20.91 
 
 
469 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  28.12 
 
 
453 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  30.38 
 
 
454 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  25.87 
 
 
462 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  25.87 
 
 
462 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  22.88 
 
 
487 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  29.3 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  29.3 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  30.86 
 
 
372 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  29.3 
 
 
469 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  21.91 
 
 
487 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  23.27 
 
 
487 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  23.38 
 
 
488 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  36.64 
 
 
642 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  36.64 
 
 
627 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  36.64 
 
 
630 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  36.64 
 
 
638 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  36.64 
 
 
623 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  36.64 
 
 
653 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  30.65 
 
 
482 aa  57  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  35.88 
 
 
635 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  21.8 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  30.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  35.88 
 
 
598 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.01 
 
 
373 aa  53.9  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  23.94 
 
 
474 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  30 
 
 
356 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.62 
 
 
475 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 
354 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  30 
 
 
373 aa  50.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.4 
 
 
373 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  26.67 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  26.67 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  27.85 
 
 
369 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  28.4 
 
 
373 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  28.4 
 
 
373 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  26.67 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  26.67 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  26.67 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  26.67 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  29.08 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  32.11 
 
 
367 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  29.08 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  29.08 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  29.08 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.46 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  27.22 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  27.22 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  27.22 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  30.1 
 
 
352 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  31.73 
 
 
356 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  31.73 
 
 
356 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  31.73 
 
 
356 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.52 
 
 
360 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  26.63 
 
 
365 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  29.52 
 
 
373 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.52 
 
 
373 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  26.92 
 
 
411 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  26.22 
 
 
345 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  26.25 
 
 
361 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  35.92 
 
 
342 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  27.04 
 
 
361 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  31.07 
 
 
347 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  31.07 
 
 
349 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  31.07 
 
 
349 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>