88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2257 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  100 
 
 
371 aa  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  55.07 
 
 
361 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  54.5 
 
 
361 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  55.89 
 
 
364 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  54.08 
 
 
364 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  54.52 
 
 
365 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  36.73 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  36 
 
 
369 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  36 
 
 
373 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  34.4 
 
 
373 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.4 
 
 
373 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  34.4 
 
 
373 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  33.87 
 
 
373 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  33.87 
 
 
373 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.13 
 
 
373 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  35.84 
 
 
337 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  35.46 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.39 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  31.18 
 
 
365 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.98 
 
 
382 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  29.92 
 
 
383 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  31.51 
 
 
366 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  30.6 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  27.84 
 
 
371 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  29.97 
 
 
362 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.91 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.33 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  31.63 
 
 
363 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  26.45 
 
 
368 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  28.95 
 
 
372 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  25.33 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.2 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  26.27 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  25.16 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.67 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.84 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  25.07 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  32.03 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.58 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  25.9 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  25.55 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  23.68 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  31.37 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  25.57 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  27.32 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  34.02 
 
 
789 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  25.29 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  42.37 
 
 
790 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  24.86 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  28.69 
 
 
518 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  30.08 
 
 
520 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  24.81 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  36.49 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  36.49 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  25.54 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  43.75 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  43.75 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  43.75 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  24.28 
 
 
365 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  43.75 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  43.75 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  43.75 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  43.75 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  25.45 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  43.75 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  25.73 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  23.3 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  30 
 
 
467 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  23.23 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  29.27 
 
 
642 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  29.27 
 
 
627 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  29.27 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  29.27 
 
 
623 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  26.03 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  29.27 
 
 
635 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  29.27 
 
 
638 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  29.27 
 
 
630 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  28.89 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  25.6 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  25.62 
 
 
356 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  25.62 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>