107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3848 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  100 
 
 		 345 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  51.31 
 
 		 346 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  39.35 
 
 		 341 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  38.37 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  38.15 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  39.53 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.82 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  36.93 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  37.46 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  35.92 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  32.56 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  31.01 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  32.49 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  34.48 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  31.3 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  32.02 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  32.57 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  47.2 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  32.57 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  31.34 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  46.58 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  46.58 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  46.58 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  46.58 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  46.58 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  46.58 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  31.21 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  29.02 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.72 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  28.9 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  28.9 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  29.39 
 
 		 356 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  28.57 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  29.24 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.65 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  31.09 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  34.25 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  34.25 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  34.25 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  34.25 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  29.03 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  29.38 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  29.38 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  29.51 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  29.03 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  29.03 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  30.88 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  29.11 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  31.49 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  30.54 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  30.54 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  30.54 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  30.54 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  37.58 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  37.58 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  30.62 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  28.75 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  28.65 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  28.02 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  29.68 
 
 		 393 aa  85.9  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.73 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  29.68 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  29.68 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.73 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.73 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  40.74 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  25.97 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.72 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  26.3 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  35 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  34.38 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  34.38 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.38 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.86 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.58 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.17 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  24.62 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  26.67 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  31.36 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  24.06 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  24.06 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  24.06 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  25.51 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  26.11 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  29.05 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  33.33 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  29.05 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  26.11 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  25.37 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  25.37 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  25.37 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  25.37 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3042  hypothetical protein  31.47 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  25.61 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  27.54 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  26.95 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  33.05 
 
 		 533 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  22.97 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  25.59 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>