89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6121 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  732    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  78.61 
 
 
361 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  62.16 
 
 
365 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  65.14 
 
 
368 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  59.46 
 
 
367 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  59.46 
 
 
367 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  56.01 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  59.46 
 
 
367 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  61.49 
 
 
345 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  60.66 
 
 
367 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  54.52 
 
 
372 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  58.18 
 
 
371 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  59.46 
 
 
367 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  54.04 
 
 
367 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  43.77 
 
 
347 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  42.82 
 
 
360 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  39.49 
 
 
356 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  42.36 
 
 
351 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  42.07 
 
 
349 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  41.79 
 
 
349 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  40.75 
 
 
354 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  37.28 
 
 
356 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  37.28 
 
 
356 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  37.28 
 
 
356 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  40.57 
 
 
352 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  29.74 
 
 
397 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  29.74 
 
 
397 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  30.31 
 
 
393 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.01 
 
 
345 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  29.22 
 
 
346 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.61 
 
 
343 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.77 
 
 
345 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  30.03 
 
 
344 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  29.05 
 
 
340 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.76 
 
 
363 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.5 
 
 
339 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  25.66 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  29.91 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  36.94 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  36.94 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  36.31 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  36.31 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  36.31 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  36.31 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  36.31 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  36.31 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  26.89 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  39.37 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  28.78 
 
 
371 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  24.92 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  25 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  26.45 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.97 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  25.37 
 
 
362 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  25.07 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.07 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  26.71 
 
 
373 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.67 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  25.67 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  25.67 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  26.16 
 
 
441 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  21.6 
 
 
314 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  24.62 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  23.21 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  21.28 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  21.28 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  21.28 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  21.28 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  23.37 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.25 
 
 
439 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.52 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  30.43 
 
 
534 aa  46.2  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  23.98 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  23.98 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  23.98 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  23.98 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  23.98 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  23.98 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  23.98 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  24.51 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  29.86 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.76 
 
 
439 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  29.06 
 
 
530 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  23.95 
 
 
366 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  18.42 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  23.73 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  28.71 
 
 
522 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  26.5 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  18.42 
 
 
328 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>