84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0291 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  98.85 
 
 
351 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  97.71 
 
 
347 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  99.14 
 
 
349 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  100 
 
 
349 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  44.92 
 
 
365 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  44.86 
 
 
367 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  43.06 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  43.68 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  43.55 
 
 
361 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  41.11 
 
 
361 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  44 
 
 
368 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  43.02 
 
 
367 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  43.22 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  42.74 
 
 
372 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  42.74 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  42.94 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  43.02 
 
 
372 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  42.98 
 
 
352 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  40.62 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  51.34 
 
 
367 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  51.34 
 
 
367 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  51.34 
 
 
367 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  51.34 
 
 
345 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  51.34 
 
 
367 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  51.34 
 
 
371 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  33.25 
 
 
397 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  33.25 
 
 
397 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  32.82 
 
 
393 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  30.5 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.36 
 
 
345 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.4 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  26.55 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.75 
 
 
363 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  33.14 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  32.13 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.62 
 
 
343 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.88 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  30.31 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.06 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  28.86 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.87 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  29.71 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  38.35 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.33 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  31.3 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  26.69 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  26.93 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  27.97 
 
 
340 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  24.56 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  24.47 
 
 
365 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  29.41 
 
 
376 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  31.91 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  31.91 
 
 
357 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  24.72 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  24.72 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  24.72 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  24.72 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  22.16 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  22.16 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  24.72 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  24.72 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  24.72 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  22.16 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.5 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  24.61 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  24.5 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  27.54 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  24.61 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  24.61 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  23.31 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  28.24 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  26.48 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  26.48 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  26.48 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  26.48 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  24 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.43 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  31.07 
 
 
530 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.26 
 
 
364 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>