98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0948 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  100 
 
 
368 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  64.52 
 
 
365 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  65.14 
 
 
361 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  62.6 
 
 
361 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  63.76 
 
 
367 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  63.76 
 
 
367 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  63.76 
 
 
367 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  64.24 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  63.81 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  63.48 
 
 
367 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  56.84 
 
 
372 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  55.07 
 
 
367 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  53.93 
 
 
372 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  73.55 
 
 
371 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  43.64 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  44.48 
 
 
347 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  40.06 
 
 
356 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  44 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  44 
 
 
349 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  43.87 
 
 
349 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  41.09 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  39.08 
 
 
356 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  39.08 
 
 
356 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  39.08 
 
 
356 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  40.8 
 
 
352 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  28.27 
 
 
393 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  28.87 
 
 
397 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  28.87 
 
 
397 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.21 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  30.14 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.19 
 
 
343 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.33 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  24.85 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  28.4 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.51 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.04 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  27.83 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  27.39 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.04 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  27.91 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  32.59 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  32.59 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  32.59 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  32.59 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  32.59 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  32.59 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  37.01 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  27.38 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  26.63 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  25.69 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  28.61 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  34.34 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  34.75 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  27.54 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  25.88 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  23 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  22.36 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  22.36 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  22.36 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  22.36 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  33.63 
 
 
369 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  33.63 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.07 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.05 
 
 
369 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  22.12 
 
 
300 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  22.05 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  25.14 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.14 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  22.05 
 
 
312 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  25.14 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  33.61 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.38 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  29.38 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  24.41 
 
 
366 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  31.86 
 
 
463 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  30.77 
 
 
533 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  26.32 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  30.87 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  23.08 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  29.52 
 
 
530 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  19.8 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  19.8 
 
 
328 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  19.8 
 
 
337 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  31.73 
 
 
534 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  28.31 
 
 
471 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  25.07 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  23.99 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  34.69 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.06 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.08 
 
 
527 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  25 
 
 
522 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.49 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>