97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1692 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  100 
 
 		 360 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  49.56 
 
 		 365 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  46.76 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  48.24 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  44.51 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  43.1 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  45.19 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  43.13 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  44.03 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  43.86 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  43.97 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  43.44 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  43.64 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  43.15 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  43.68 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  43.68 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  45.48 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  45.48 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  45.48 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  45.48 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  45.82 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  45.8 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  45.48 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  43.93 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  44.79 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  31.4 
 
 		 397 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  31.4 
 
 		 397 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  29.6 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.53 
 
 		 345 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  30.58 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  31.1 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.53 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.72 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  28.24 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.94 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  29.79 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  38.92 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  38.32 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  38.32 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  38.32 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  38.32 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  38.32 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  38.32 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  32.44 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.81 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  28.82 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  27.46 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  40.31 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  40.5 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  27.12 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  25.36 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  25.07 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  24.79 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  24.86 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.82 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  24.79 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  32.74 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  26.09 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  31.37 
 
 		 534 aa  52.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  23.87 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.83 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  28.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  28.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  28.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  28.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  28.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  28.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  24.29 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  29.52 
 
 		 530 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  27.47 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  30.28 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3042  hypothetical protein  26.9 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  23.96 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  26.35 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.83 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  30.17 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  24.46 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.31 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  30.23 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  29.31 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  30.23 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  24.17 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.4 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  24.55 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  29.7 
 
 		 528 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.31 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  29.31 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  29.31 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  28.43 
 
 		 533 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  28.43 
 
 		 533 aa  42.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  28.43 
 
 		 533 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.76 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>