102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0192 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  100 
 
 		 363 aa  718    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  42.37 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  46.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  45.04 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  38.86 
 
 		 339 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  45.33 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  45.33 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  45.33 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  45.33 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  45.33 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  45.33 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  38.81 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  39.12 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  42.01 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  36.06 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.38 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.38 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  30.66 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  30.9 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  29.97 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  30.79 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.22 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  29.71 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  30.52 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  31.37 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  29.3 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  29.4 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  29.12 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  30.29 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  29.12 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  28.08 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  28.08 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  29.12 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  27.12 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  29.69 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  29.69 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  29.69 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  41.26 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  29.46 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  28.37 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  43.1 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  28.42 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  30.4 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  33.99 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  33.99 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  33.99 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  33.99 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  33.99 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  33.99 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  33.99 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  21.25 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  21.25 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  21.25 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  24.3 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  26.91 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  27.72 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  23.99 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  25.27 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  25.73 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  25.73 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  25.73 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  25.73 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  25.73 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  25.73 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  25.73 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  27.45 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  41.94 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  26.72 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  41.94 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.04 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.59 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  26.08 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  25.13 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  32.43 
 
 		 790 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  24.68 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.59 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.68 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  24.17 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  29.23 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  29.23 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.23 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.7 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  24.7 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  23.91 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.29 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  31.19 
 
 		 789 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  23.22 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  24.7 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  34.43 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  34.43 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  34.43 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  34.43 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  34.43 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  34.43 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  34.43 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  23.81 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  29.36 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3042  hypothetical protein  30.91 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.27 
 
 		 508 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>