39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3042 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  801    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  39.08 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  29.81 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  29.8 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  29.69 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.43 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.48 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  27.54 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  25.71 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.03 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  27.84 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  26.78 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  27.3 
 
 		 351 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  25 
 
 		 362 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  26.93 
 
 		 349 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  28.82 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.8 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.67 
 
 		 339 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  27.7 
 
 		 367 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  25.47 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.91 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  25.08 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  29.15 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  25.49 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  35.66 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  26.09 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  27.2 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  26.25 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  31.16 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  33.9 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  31.16 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  31.16 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  33.9 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  31.16 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  30.73 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  31.16 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  26.78 
 
 		 376 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  30.73 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  24.71 
 
 		 361 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>