50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0018 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  965    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  45.11 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  43.87 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  34.44 
 
 		 482 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  32.61 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  34.97 
 
 		 462 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  36.14 
 
 		 462 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  32.98 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  31.95 
 
 		 474 aa  240  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  32.64 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  33.41 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  31.73 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  32.53 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  32.53 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  30.91 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  24.74 
 
 		 488 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  26.69 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  25.69 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  24.95 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.76 
 
 		 533 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  24.62 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  23.25 
 
 		 518 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  23.19 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  23.54 
 
 		 518 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  23.35 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  21.93 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  21.93 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  22.76 
 
 		 789 aa  93.2  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1180  putative nucleobase:cation symporter  22.74 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  25.82 
 
 		 790 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  26.46 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  22.48 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  25.58 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  28.48 
 
 		 598 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  28.67 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  28.67 
 
 		 638 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  28.67 
 
 		 653 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  28.67 
 
 		 630 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  28.67 
 
 		 635 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  22.07 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  28.67 
 
 		 623 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  28.67 
 
 		 627 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  26 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  26 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  26 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  26.59 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  22.12 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  28.57 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  28.57 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  26.02 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>