More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2427 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  100 
 
 		 322 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  37.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  33.99 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  36.07 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  36.4 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  31.36 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  32.41 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  31.08 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  30.85 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  35.4 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  34.01 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  30.82 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  33.92 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  31.99 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  31.65 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  32.84 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  30.69 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  33.09 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  32.54 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  30.87 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  33.81 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  30.66 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  30.29 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  30.8 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.07 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  30.66 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  28.77 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.28 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  28.2 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  29.1 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.62 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.93 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.68 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.99 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.33 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  50 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  33.11 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  33.11 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  45.24 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  44.33 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44.33 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  44.33 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.15 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.33 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  47.56 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.68 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.1 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  37.32 
 
 		 653 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  34.97 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.89 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  39.13 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.76 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.83 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  41.41 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.83 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  44.21 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>