More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1393 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  66.89 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  70.88 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  71.07 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  61.66 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  68.73 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  61.49 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  62.46 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  60.76 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  60.32 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  36.86 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  33.77 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  31.14 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  30.04 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  27.7 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  28.93 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.24 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  27.18 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  27.34 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  28.15 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  26.71 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  28.92 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  29.51 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  30.35 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  25.09 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.89 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  28.35 
 
 		 339 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.67 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 638 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.11 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.06 
 
 		 544 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.27 
 
 		 656 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.3 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.53 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.54 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  36.28 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.02 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  44.93 
 
 		 1026 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39.81 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39.81 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  35.58 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.53 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  44.29 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.07 
 
 		 641 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.61 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  31.36 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37.25 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.76 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  34.75 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.26 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.07 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.08 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.08 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  34.31 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  30.28 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  42.53 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  42.53 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>