More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1532 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  610  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  36.86 
 
 
315 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  38.52 
 
 
321 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  39.26 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  37.69 
 
 
317 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  37.69 
 
 
313 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  34.28 
 
 
300 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
308 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 
309 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  37.54 
 
 
322 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  35.07 
 
 
302 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
289 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
289 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
289 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
289 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  38.29 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  35.74 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  36.06 
 
 
289 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  34.02 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.02 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  33.68 
 
 
290 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  31.97 
 
 
291 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  31.12 
 
 
287 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  31.14 
 
 
292 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  32.89 
 
 
294 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  34.33 
 
 
294 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  29.9 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  33.46 
 
 
303 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.66 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  27.95 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  31.29 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  32.06 
 
 
339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  29.23 
 
 
350 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.09 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  45.1 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 
542 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  42.45 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.45 
 
 
220 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  24.92 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.67 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
220 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  33.62 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  50 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  48.72 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 
638 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  29.35 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 
623 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  36.11 
 
 
648 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.06 
 
 
525 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.18 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.53 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.27 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  45.07 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.1 
 
 
231 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40 
 
 
214 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
533 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  32.12 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.73 
 
 
707 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  43.53 
 
 
630 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.66 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  32.41 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
537 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.2 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 
456 aa  65.9  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  43.42 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>