More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1116 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  87.54 
 
 		 313 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  86.89 
 
 		 317 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  86.93 
 
 		 308 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  71.28 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  69.54 
 
 		 302 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  71.28 
 
 		 301 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  62.89 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  63.18 
 
 		 321 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  61.84 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  30.95 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  30.88 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  30.18 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  30.45 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  28.26 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  25.95 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  27.34 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  27.2 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  27.52 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  26.99 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  26.07 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.15 
 
 		 292 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  24.49 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  26.5 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.07 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  27.13 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.3 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.4 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  25.95 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  25.8 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  25.8 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  26 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  24.36 
 
 		 289 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  26.87 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  27.96 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.3 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.3 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.54 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.3 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.3 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.24 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 638 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.04 
 
 		 670 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.78 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  41.24 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.33 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  29.6 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  47.89 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.63 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.54 
 
 		 179 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.78 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  33.94 
 
 		 464 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  41 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  41 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  41 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  41 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.95 
 
 		 630 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  41 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 658 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  37.5 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  41 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  41 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  35.14 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.57 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.57 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.14 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.73 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 1026 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.26 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.78 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  42.11 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.78 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  42.11 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>