More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1601 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  89.97 
 
 
289 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  89.97 
 
 
289 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  89.97 
 
 
289 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  89.97 
 
 
289 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  89.62 
 
 
290 aa  557  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  89.27 
 
 
290 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  88.58 
 
 
290 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  73.7 
 
 
297 aa  471  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 
289 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  71.97 
 
 
289 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  73.84 
 
 
286 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  74.28 
 
 
289 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  66.44 
 
 
289 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  67.47 
 
 
289 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  45.67 
 
 
290 aa  292  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  44.41 
 
 
287 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  43.71 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  43.61 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  90.91 
 
 
122 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  41.9 
 
 
294 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  42.2 
 
 
293 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.99 
 
 
292 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  35.74 
 
 
296 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  31.65 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 
309 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  29.81 
 
 
321 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.07 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 
315 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  28.62 
 
 
321 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  28.62 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  26.86 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 
313 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  25.35 
 
 
317 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.05 
 
 
301 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 
308 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  28.83 
 
 
339 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  27.33 
 
 
324 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  25.8 
 
 
324 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.24 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  25.74 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.79 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  26.57 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.26 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 
217 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.56 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.72 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.72 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  46.05 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  44 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.78 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.74 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.33 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  46.05 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  36.27 
 
 
464 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.56 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.7 
 
 
890 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.79 
 
 
641 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.53 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 
679 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.33 
 
 
607 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.57 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  41.57 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  47.89 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
537 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  29.52 
 
 
451 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 
1264 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 
440 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  28.23 
 
 
459 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.71 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.99 
 
 
656 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 
514 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.21 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  32.17 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.96 
 
 
224 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 
220 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  34 
 
 
348 aa  62.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  41.67 
 
 
505 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 
537 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 
216 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  35.29 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.31 
 
 
542 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  34.44 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  34.95 
 
 
185 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>