More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1863 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  100 
 
 
292 aa  608  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  65.75 
 
 
293 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  65.98 
 
 
293 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  65.75 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  43.12 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  41.02 
 
 
291 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
289 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
289 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
289 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
289 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  40.55 
 
 
290 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  40.48 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  40.99 
 
 
289 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  40.21 
 
 
290 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  40.55 
 
 
290 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  40.64 
 
 
297 aa  238  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 
286 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
289 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  40.6 
 
 
289 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  41.2 
 
 
289 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  38.29 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 
296 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  29.86 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.86 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  30.8 
 
 
321 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  28.27 
 
 
302 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  30.08 
 
 
321 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  28.32 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  28.32 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  28.17 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  29.28 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  25.87 
 
 
308 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  43.22 
 
 
122 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.05 
 
 
301 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  26.15 
 
 
324 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  25.16 
 
 
324 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.86 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.52 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  26.37 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.38 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.83 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  41 
 
 
168 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.05 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.4 
 
 
447 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  25.87 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.03 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.03 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  38.24 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
498 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.7 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  49.3 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  37.07 
 
 
575 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.5 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 
459 aa  68.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
514 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.94 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  40 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  34.17 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  38.68 
 
 
242 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  32.08 
 
 
195 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 
205 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.27 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.54 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.03 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.45 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  36.54 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.48 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.64 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  24.05 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  36 
 
 
166 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.94 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.91 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  45.83 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>