More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4518 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  76.35 
 
 		 300 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  70.13 
 
 		 313 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  69.8 
 
 		 317 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  69.54 
 
 		 324 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  68.42 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  77.59 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  64.01 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  64.73 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  64.16 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  35.07 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  32.41 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  28.27 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  27.62 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  26.55 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  27.8 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  27.72 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  27.68 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  28.27 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  28.93 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  28.03 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  27.99 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  28 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  26.57 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  27.99 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.84 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  26.86 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  27.88 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.8 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  27.78 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.86 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  27.91 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  26.24 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  29.64 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  24.37 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  43.02 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  39.78 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  25.44 
 
 		 620 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 638 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  31.97 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  39.18 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.38 
 
 		 509 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 490 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.63 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.97 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.24 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.65 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40.85 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.99 
 
 		 1793 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  32.41 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.04 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 		 1755 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 		 679 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.04 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  32.17 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  39.73 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  36.97 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1987 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 543 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  43.84 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 544 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  40.79 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  40.79 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  31.73 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  34.55 
 
 		 591 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>