49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3511 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1295    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  82.57 
 
 		 670 aa  906    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  97.91 
 
 		 669 aa  1189    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  47.08 
 
 		 630 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  44.27 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  46.17 
 
 		 684 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.36 
 
 		 707 aa  127  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  29.63 
 
 		 464 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.43 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  31.07 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  28.28 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  27.69 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  27.22 
 
 		 459 aa  104  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  32.95 
 
 		 463 aa  100  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  32.82 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  35.07 
 
 		 211 aa  90.5  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  27.43 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  26.86 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  30.46 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_004310  BR0640  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  28.57 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  25.71 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  27.01 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0635  hypothetical protein  27.49 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.74 
 
 		 320 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  25.29 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  25.29 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  25.29 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  25.29 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  25.29 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 316 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 316 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  25.29 
 
 		 310 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  25.29 
 
 		 310 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  26.29 
 
 		 617 aa  54.3  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  26.44 
 
 		 277 aa  54.3  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  22.94 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  37.18 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  23.6 
 
 		 261 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 434 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2634  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 271 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  24.95 
 
 		 768 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  28.37 
 
 		 245 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.82 
 
 		 241 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>