44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1480 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  73.69 
 
 		 630 aa  763    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 612 aa  1169    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  45.31 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  45.51 
 
 		 668 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  45.34 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  46.84 
 
 		 684 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 		 729 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  29.28 
 
 		 464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  30.35 
 
 		 464 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  27.36 
 
 		 707 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  29.88 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  30.85 
 
 		 464 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  32.35 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  29.95 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  28.17 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  24.95 
 
 		 768 aa  64.3  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  28.37 
 
 		 211 aa  60.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  24.43 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  25.73 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  24.43 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  24.43 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  27.66 
 
 		 222 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  24.82 
 
 		 218 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  28.93 
 
 		 434 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  28.35 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_004310  BR0640  hypothetical protein  27.68 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  26.04 
 
 		 617 aa  47.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  26.95 
 
 		 222 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  26.13 
 
 		 217 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2634  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 271 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  23.86 
 
 		 247 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  23.86 
 
 		 316 aa  47.4  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0635  hypothetical protein  27.68 
 
 		 213 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  23.86 
 
 		 316 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  23.86 
 
 		 316 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  26.83 
 
 		 227 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  23.86 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  23.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  23.84 
 
 		 316 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  23.84 
 
 		 316 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  22.75 
 
 		 320 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  21.76 
 
 		 277 aa  44.3  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  47.83 
 
 		 224 aa  44.3  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>